Ben, je ne suis pas d'accord.
D'abord Philippe Prados, c'est un bon, ensuite c'est un copain, et enfin c'est un auteur dans Programmez! (moins ces derniers temps il est vrai, mais ça ne lui enlève rien)
Dans le document que tu cites, il dit que les références peuvent être pénalisantes parce que fois initialisées tu ne peux pas les ré-affecter, ce qui est vrai. Mais il ne dit pas qu'il ne faut pas avoir références comme membres de classes.
Bon c'est sûr que si tu dois réaffecter la référence ne vas pas, et l'auto_ptr va bien sous réserve (j'insiste) que l'objet dont il est membre ne soit pas copié lui même. Tu peux aussi avoir un simple pointeur si la classe qui le détient n'est pas responsable de la gestion de la durée de vie de l'objet pointé.