salut :)

Ton problème doit être clarifié pour commencer.

Pourquoi un .bat ?
Tu as divorcé d'avec Java au fait ? :D

Linux c'est bien gentil ça, mais il est censé être servi comment ce fichier ?

Ftp ? ssh ? autre ?

Cela dit ton .bat c'est tout simple. Dedans tu invoques le client dont tu as besoin.
Si ton .bat est celui que tu veux appeler depuis Java (dans ton autre message d'hier) alors ça serait peut être plus compliqué par exemple si le serveur te demande un mot de passe. Mais peut être aussi que tu n'as pas besoin d'un .bat, mais simplement d'appeler le client depuis Java, ou peut être aussi que tu n'as pas besoin de client du tout et que tu peux récupérer le fichier simplement en Java.
Le tout est d'abord de savoir comment est servi ce fichier, ce que tu ne dit pas.