J'aime bien ce que fait Borland, la plupart du temps...

Mais leur méthode "jbInit()" c'est une horreur !
Je n'y comprends jamais rien... Oui, je sais, on va me répondre que ce n'est pas la peine de la regarder puisqu'elle est générée automatiquement.
En fait, je hais les générateurs automatiques. Le programmeur n'est plus le maître de sa réalisation et du coup, quand ça foire, il est perdu...!

Mon conseil c'est : Quand tu n'arrives pas à résoudre un problème, décompose-le en plusieurs, jusqu'à ce qu'ils soient suffisament petits pour que tu puisse les résoudre un par un.

Concrétement dans ton cas, à ta place je ferais plus de classes (d'abord une par JPanel) ce qui segmentera ton graphisme. Après tu pourras essayer de les afficher une à une, puis à plusieurs ensemble... jusqu'à trouver ce qui fait que cela ne s'affiche pas correctement.