C'est très difficile ça.
Bon par exemple tu peux générer une clé de licence basée sur le numéro de série du bios ou sur l'adresse MAC de la carte réseau (si elle existe).
Mais c'est plus générateur d'ennuis qu'autre chose ce genre de solution.
Par exemple chaque fois qu'un de tes clients va flasher son BIOS, tu vas recevoir un coup de fil rageur...
Sinon il y a les protections matérielles, avec des dongles. Mais c'est onéreux à mettre en place. Alors faut amortir en vendant beaucoup de licences.

Sinon il y la solution de faire confiance au client. Ca ne fonctionne pas si mal en général. Ca dépend grandement du profil du client.