Ca dépend du volume de données à traiter, et de ce que tu veux en faire, ce que je n'arrive pas à te faire dire.
Entre une petite appli personnelle qui montre l'arbre généalogique de ta famille, de ta belle famille et de ta petite amie seulement et sur 5 générations seulement et un site de généalogie très sollicité et montrant des miliers d'arbres sur une centaines de générations la donne n'est pas la même. Donc on ne choisira pas nécessairement le(s) même(s) outil(s)

Les langages (très) adaptés aux arbres sont les langages fonctionnels. Mais j'ose à peine le murmurer, j'entends déjà les sarcasmes des obscurantistes... :lol:
Sinon tout langage qui supporte la récursivité fera l'affaire, plus ou (beaucoup) moins bien selon les besoins à satisfaire.